La production de tomates et de poivrons confrontée à de nouvelles menaces
De nouvelles souches de virus surmontent les principaux gènes de résistance des cultures
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Une équipe de recherche composée de virologues du département des virus des plantes de l'Institut Leibniz DSMZ-Collection allemande de micro-organismes et de cultures cellulaires, du Conseil national de la recherche italien et de BASF-Nunhems Italie, a récemment publié les résultats d'une collaboration scientifique visant à étudier l'apparition de souches à résistance brisée du virus de la flétrissure ponctuée de la tomate (TSWV) dans les champs de tomates et de poivrons. Les résultats, qui prouvent pour la première fois l'émergence de souches à double résistance (D-RB) du TSWV en milieu agricole, ont été publiés dans la revue scientifique Virology.
Symptôme de tache annulaire causé par le virus du flétrissement bactérien de la tomate sur le poivron
Copyright: DSMZ
Un nouveau scénario dans l'agriculture
L'étude met en évidence un nouveau risque dans la gestion du virus du flétrissement bactérien de la tomate, l'un des virus végétaux les plus dévastateurs, étant donné sa capacité à infecter un grand nombre de cultures ornementales et légumières dans le monde entier, y compris la tomate et le poivron. En cas d'infection, le rendement de la culture est réduit et, en cas d'épidémies graves, des champs entiers subissent des pertes économiques substantielles. Traditionnellement, la stratégie la plus efficace pour limiter le TSWV associe l'utilisation de cultivars résistants à la lutte contre les insectes vecteurs. Cette étude fait état d'un nouveau scénario sur le terrain. "La résistance au TSWV de la tomate et du poivron étant basée sur des gènes différents, la culture alternée de variétés de tomates et de poivrons a longtemps été considérée comme une stratégie sûre et durable pour réduire le risque d'épidémies liées à l'émergence de souches virales brisant la résistance. Notre étude fait état d'un nouveau scénario, dans lequel des souches de TSWV capables de surmonter la résistance dans les deux cultures ont été identifiées", résume le Dr Paolo Margaria, chef du groupe Discovery and Diversity au département des virus des plantes de la DSMZ.
Impact des résultats de la recherche sur les pratiques agronomiques et les stratégies de gestion des maladies
L'étude souligne que certaines pratiques agronomiques, notamment l'alternance de cultivars résistants ou la culture de tomates et de poivrons résistants à proximité les uns des autres, peuvent involontairement favoriser la sélection et la propagation de ces variantes virales plus agressives. Ce scénario s'est déjà produit en Italie et pourrait s'appliquer à d'autres régions du monde. "Nos résultats ouvrent de nouvelles perspectives pour les systèmes de production dans lesquels la tomate et le poivron sont cultivés à proximité l'un de l'autre, et appellent à une réévaluation des pratiques agronomiques actuelles et des stratégies de gestion des maladies. En particulier, nous recommandons un dépistage systématique des souches D-RB du TSWV partout où les deux plantes sont cultivées à proximité l'une de l'autre. La surveillance et des approches de gestion adaptées seront essentielles pour réduire le risque, la propagation et l'impact de ces nouvelles souches virales et pour préserver la production agricole", conclut Paolo Margaria. Dans le contexte de l'étude, la caractérisation moléculaire précise des séquences génomiques des souches D-RB a mis en évidence la présence d'un résidu d'acide aminé dans la protéine de mouvement qui permet au virus de briser la résistance et qui n'avait pas été révélé jusqu'à présent dans les contextes italiens. Dans l'ensemble, les résultats de la recherche constituent une ressource importante et précieuse pour l'étude des mécanismes de résistance et des réponses des plantes dans des cultures d'importance majeure.
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Publication originale
M. Forgia, P. Margaria, M. Mammella, M. Ciuffo; "Characterization of Italian resistance-breaking isolates of tomato spotted wilt virus reveals double resistance-breaking strains in tomato and pepper and new insights into the occurrence of the recently reported D122G substitution in the NSm protein"; Virology, Volume 618
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