Die Duftende Korallenraute wächst als aufrechter, schlanker Strauch, der Wuchshöhen von maximal 2 Meter erreicht. Alle Pflanzenteile duften, da sie Drüsen enthalten, welche die ätherischen Öle produzieren. Die Laubblätter stehen wirtelig an dünnen Zweigen. Die aus drei, selten aus fünf Blättchen zusammengesetzten, dunkelgrünen Laubblätter sind bis 1,5 cm lang, schmal und dick.
Die Blütezeit reicht von Juli bis Oktober. Die zwittrigen Blüten sind bei einem Durchmesser von etwa 1 cm becherförmig. Die Blütenfarben sind außen braun bis rötlich-violett und innen intensiv gelb; einige Sorten besitzen andere Farben. In der Zeit, in der die Stempel für Pollen empfänglich sind, ist die Aktivität der Duftdrüsen am höchsten, was darauf schließen lässt, dass dadurch befruchtende Insekten angelockt werden sollen.
