L'élevage industriel de volailles accélère la propagation d'une maladie d'origine alimentaire majeure
Une nouvelle étude menée par l’Ineos Oxford Institute for antimicrobial research, à l’université d’Oxford, révèle que l’élevage industriel de volailles a entraîné une multiplication par plus de 100 de la propagation de Campylobacter, permettant ainsi à des souches qui circulaient autrefois chez les oiseaux sauvages de se mélanger largement au sein des populations de volailles d’élevage.
Le professeur Samuel Sheppard, responsable scientifique en microbiologie numérique et bioinformatique à l'Institut Ineos d'Oxford pour la recherche sur les antimicrobiens (IOI).
Ineos Oxford Institute for antimicrobial research (IOI).
Campylobacter est la bactérie responsable de la diarrhée la plus courante au monde ; au Royaume-Uni, elle provoque chaque année plus de 3,5 fois plus de cas de gastro-entérite que toutes les autres bactéries d'origine alimentaire surveillées réunies. La hausse des taux de résistance aux antimicrobiens (RAM), qui survient lorsque les bactéries résistent aux médicaments destinés à les éliminer, rend les infections à Campylobacter de plus en plus difficiles à traiter.
Dans cette nouvelle étude, publiée dans les Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS), les chercheurs ont analysé près de 2 800 génomes bactériens prélevés sur des poulets et des oiseaux sauvages dans 30 pays (dont le Royaume-Uni et les États-Unis) entre 1979 et 2024. Ils ont constaté que l’énorme expansion mondiale de l’élevage de poulets a créé des conditions idéales pour que la bactérie se propage, se mélange et acquière de nouveaux traits qui l’aident à survivre.
Depuis les années 1960, le nombre de poulets dans le monde a été multiplié par sept pour atteindre environ 31 milliards d’oiseaux. Aujourd’hui, les poulets représentent environ 70 % de la biomasse aviaire totale sur Terre. Si cette augmentation des effectifs a permis la production à grande échelle de protéines animales à un prix abordable, elle a également créé des conditions idéales pour que les bactéries s’adaptent et se propagent.
À l’aide d’analyses génomiques, les chercheurs ont identifié des modifications génétiques chez Campylobacter associées à une adaptation à l’environnement avicole. Parmi celles-ci figuraient des gènes impliqués dans la résistance aux antimicrobiens, la tolérance au stress oxydatif, l’acquisition de métaux et la motilité, ainsi que des caractéristiques pouvant aider les bactéries à survivre et à prospérer dans les systèmes modernes de production avicole.
Le professeur Sam Sheppard, professeur de génomique microbienne et d’évolution à l’université d’Oxford et auteur principal de l’article, a déclaré : « L’élevage industriel a créé l’un des plus grands habitats animaux de la planète. Nos résultats apportent de nouvelles preuves que les changements environnementaux induits par l’homme peuvent favoriser la propagation des maladies infectieuses.
« À mesure que les populations de poulets se sont développées, les bactéries qui étaient autrefois largement confinées aux oiseaux sauvages ont eu bien plus d’occasions de pénétrer dans les troupeaux de volailles, de se propager et de s’y implanter. Il est essentiel de comprendre ces conséquences évolutives si nous voulons réduire les risques futurs liés aux maladies zoonotiques et à la résistance aux antimicrobiens. »
L’étude suggère également que les vastes élevages de poulets densément peuplés peuvent agir comme des « éponges à agents pathogènes » écologiques, absorbant et amplifiant des souches bactériennes provenant de multiples sources. La modélisation mathématique a montré qu’une fois que les populations de poulets atteignent une taille critique, les souches provenant d’oiseaux sauvages peuvent se maintenir de manière autonome au sein des populations de volailles, même lorsqu’elles sont mal adaptées à leur nouvel hôte.
Une étude précédente de l’IOI a révélé que 80 % des infections humaines à Campylobacter dans l’Oxfordshire sont associées à la viande de volaille, et que bon nombre de ces infections sont résistantes aux antibiotiques.
Oakem Kyne, doctorant à l’université d’Oxford et premier auteur de l’article, a déclaré : « À mesure que les souches de Campylobacter s’adaptent à la vie chez les volailles, elles peuvent acquérir des caractéristiques qui les aident à survivre dans des environnements difficiles, notamment des caractéristiques liées à la résistance aux antimicrobiens. Comprendre comment les pratiques agricoles influencent l’évolution bactérienne constitue une étape importante vers la réduction du fardeau des maladies d’origine alimentaire. »
Note: Cet article a été traduit à l'aide d'un système informatique sans intervention humaine. LUMITOS propose ces traductions automatiques pour présenter un plus large éventail d'actualités. Comme cet article a été traduit avec traduction automatique, il est possible qu'il contienne des erreurs de vocabulaire, de syntaxe ou de grammaire. L'article original dans Anglais peut être trouvé ici.
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